《史诗战斗幻想 3》的故事发生在《史诗幻想2》完结后的几年，两位主角结识了新伙伴（貌似是不打不相识），三人组队成为了宝物猎人。某天他们发现了一古墓，里面的东西（Akron）看似还活着，主角们好奇地戳了他一下，Akron突然醒来，发出强大的震荡波将主角们震慑住了，并开始吸收他们的能量。幸好主角们能量过剩，没被吸完，醒来后发现自己在一个陌生的地方，于是他们开始了寻找装备和复仇(?)的旅程……
      《史诗战斗幻想 3》游戏完成后，可以重新游戏，此时可以选择继承装备、等级等，而且永久属性的食物也能再拿一次。但是如此做难度便不能更换，想换难度就一切重来吧……怪物图鉴和成就是保留的。

考虑到这里有幼龄茶叶，特此提示：游戏有部分细节比较邪恶，请幼龄茶叶们保持正确的心态看待这些内容。