《沉默的舰队２》是由漫画《沉默的舰队》改编的游戏。故事是以最新型的核能潜水舰“海蝙蝠”，“大和”号的舰长－海江田四郎为主轴，指挥着这艘潜舰展开故事。在      《沉默的舰队２》中，玩家将跟着原作中的进度，扮演海江田四郎、深町洋两位潜舰舰长，体验原作中一场场的战役。若达成特定条件，甚至还能引发原作中所没有出现的特殊剧情。

     潜舰作战不同于一般舰艇战，身处海底，作战范围是三度空间而非平面，在《沉默的舰队２》中，除了要拍发主动声纳搜寻看不见的敌人之外，航向、潜舵、水槽注水、下潜等潜舰操舵手精密的操作，也全都在游戏中一一忠实的重现；装填鱼雷时除了选择种类之外，鱼雷的追踪模式、弹头、回旋方向等也都要一一设定，精细的程度，让人感觉有如置身于世界最先进的核子动力潜舰一般！

     故事内容以「逼真的军事战争」和「国际势力的斗争」为骨干，叙述美日两国共同开发了一艘核能潜水艇“海蝙蝠号”，没想到新任舰长海江田四郎竟然与部属联合叛逃，向全世界宣言他们的潜水艇是自主独立国“大和”，引起世界各国军方全力扑杀，但是海江田以卓绝的战斗武力，向世界强权国家宣示他们争取自由的决心，并在联合国大会上发言，以恳切的言辞向全世界宣扬“世界一家”的理念。由于内容牵涉到世界各国，逼真紧迫的内容，在不少国家引起同理心，在台湾也因为处境类似剧情内容，引起广大读者的共鸣。